善導寺為了彌補國內博物館對魏晉至唐宋年間石雕藝術的不足,便廣泛蒐集魏晉以來各類佛像及文物,於民國七十五年成立佛教歷史博物館,開放給民眾參觀。
全館共分為三間陳列室,分別設置於五、六、七三個樓層,展示各型的佛像雕刻、佛畫等藝術精品,而其中又以五樓收藏的佛陀舍利最為珍貴。